Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms