Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms