Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms