Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20425E9Q035 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20425E9Q035 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms