Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc1Q9QZF2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Gpc1Q9QZF2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Gpc1Q9QZF2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Gpc1Q9QZF2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Gpc1Q9QZF2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Gpc1Q9QZF2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Gpc1Q9QZF2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gpc1Q9QZF2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Gpc1Q9QZF2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc1Q9QZF2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc1Q9QZF2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc1Q9QZF2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc1Q9QZF2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc1Q9QZF2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc1Q9QZF2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc1Q9QZF2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc1Q9QZF2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Gpc1Q9QZF2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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