Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnckQ9QYK9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms