Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tspan11Q9D1D1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms