Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SardhQ99LB7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SardhQ99LB7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms