Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2surpQ6NV83 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms