Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms