Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pfdn6Q03958 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn6Q03958 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms