Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.9 ms