Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms