Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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