Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms