Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms