Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2surpQ6NV83 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms