Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Prdm6Q3UZD5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Prdm6Q3UZD5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Prdm6Q3UZD5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Prdm6Q3UZD5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Prdm6Q3UZD5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Prdm6Q3UZD5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Prdm6Q3UZD5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Prdm6Q3UZD5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Prdm6Q3UZD5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Prdm6Q3UZD5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm6Q3UZD5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm6Q3UZD5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms