Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms