Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Q08AU9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Q08AU9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Q08AU9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q08AU9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q08AU9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q08AU9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q08AU9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q08AU9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q08AU9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q08AU9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q08AU9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q08AU9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q08AU9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q08AU9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q08AU9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q08AU9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms