Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MitfQ08874 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms