Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms