Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms