Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif3aP28741 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms