Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lama1P19137 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lama1P19137 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms