Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prf1P10820 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prf1P10820 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms