Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f6O54917 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2f6O54917 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms