Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb10O35955 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms