Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Catsperg2C6KI89 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms