Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms