Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col5a3Q9JLI2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms