Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3glb1Q9JK48 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3glb1Q9JK48 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3glb1Q9JK48 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms