Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms