Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE7

Uncharacterized protein C11orf97 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9DAE7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DAE7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms