Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan11Q9D1D1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms