Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsnaxip1Q99P25 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms