Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol9aQ8VDU3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms