Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms