Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SrrdQ8K2M3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SrrdQ8K2M3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SrrdQ8K2M3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SrrdQ8K2M3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SrrdQ8K2M3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SrrdQ8K2M3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SrrdQ8K2M3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SrrdQ8K2M3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SrrdQ8K2M3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SrrdQ8K2M3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SrrdQ8K2M3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SrrdQ8K2M3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SrrdQ8K2M3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SrrdQ8K2M3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SrrdQ8K2M3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SrrdQ8K2M3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SrrdQ8K2M3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SrrdQ8K2M3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SrrdQ8K2M3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SrrdQ8K2M3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SrrdQ8K2M3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SrrdQ8K2M3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SrrdQ8K2M3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SrrdQ8K2M3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SrrdQ8K2M3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SrrdQ8K2M3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SrrdQ8K2M3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SrrdQ8K2M3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SrrdQ8K2M3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SrrdQ8K2M3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SrrdQ8K2M3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SrrdQ8K2M3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SrrdQ8K2M3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SrrdQ8K2M3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SrrdQ8K2M3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SrrdQ8K2M3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SrrdQ8K2M3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SrrdQ8K2M3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SrrdQ8K2M3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SrrdQ8K2M3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SrrdQ8K2M3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SrrdQ8K2M3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SrrdQ8K2M3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SrrdQ8K2M3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SrrdQ8K2M3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SrrdQ8K2M3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SrrdQ8K2M3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SrrdQ8K2M3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SrrdQ8K2M3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SrrdQ8K2M3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SrrdQ8K2M3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SrrdQ8K2M3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SrrdQ8K2M3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SrrdQ8K2M3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrrdQ8K2M3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrrdQ8K2M3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrrdQ8K2M3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SrrdQ8K2M3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SrrdQ8K2M3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SrrdQ8K2M3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SrrdQ8K2M3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SrrdQ8K2M3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SrrdQ8K2M3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SrrdQ8K2M3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SrrdQ8K2M3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrrdQ8K2M3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrrdQ8K2M3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrrdQ8K2M3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrrdQ8K2M3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrrdQ8K2M3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SrrdQ8K2M3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrrdQ8K2M3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SrrdQ8K2M3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SrrdQ8K2M3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SrrdQ8K2M3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SrrdQ8K2M3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SrrdQ8K2M3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SrrdQ8K2M3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SrrdQ8K2M3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SrrdQ8K2M3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrrdQ8K2M3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrrdQ8K2M3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrrdQ8K2M3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SrrdQ8K2M3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SrrdQ8K2M3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SrrdQ8K2M3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SrrdQ8K2M3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SrrdQ8K2M3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SrrdQ8K2M3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SrrdQ8K2M3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SrrdQ8K2M3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SrrdQ8K2M3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SrrdQ8K2M3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrrdQ8K2M3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrrdQ8K2M3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SrrdQ8K2M3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SrrdQ8K2M3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SrrdQ8K2M3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SrrdQ8K2M3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms