Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn2Q6PHP6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn2Q6PHP6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms