Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb40Q6PCS8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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