Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2surpQ6NV83 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms