Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9cQ66X01 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms