Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UST5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UST5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UST5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UST5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UST5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UST5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UST5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UST5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UST5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UST5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UST5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UST5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UST5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UST5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UST5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UST5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UST5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UST5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UST5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UST5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UST5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UST5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UST5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UST5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms