Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MitfQ08874 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms