Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm2aP59997 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2aP59997 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms