Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl9P51670 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms