Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbip1J3QMK2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms