Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edf1Q9JMG1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Edf1Q9JMG1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms