Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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Col5a3Q9JLI2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Col5a3Q9JLI2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Col5a3Q9JLI2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col5a3Q9JLI2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms